Pan-Resistant Organism Infections in an Ivorian Hospital Setting: Therapeutic Failure and Risk Factors in 7 Patients: Infections à Germes Pan-Résistants en Milieu Hospitalier Ivoirien : Échec Thérapeutique et Facteurs de Risque chez 7 Patients

Abstract

RÉSUMÉ
Introduction. La pan-résistance bactérienne, définie par une résistance à toutes les classes d'antibiotiques disponibles, représente une menace croissante dans les pays à ressources limitées, où les options thérapeutiques sont déjà restreintes. En Afrique subsaharienne, les données sur ces infections sont rares. Cette étude rapporte notre expérience dans la prise en charge des infections à bactéries pan-résistantes documentées au Service des Maladies Infectieuses (SMIT) d'Abidjan entre mars 2020 et février 2022. Méthodes. Nous avons mené une étude observationnelle rétrospective descriptive incluant tous les patients hospitalisés au SMIT chez qui une bactérie pan-résistante (résistance à tous les antibiotiques testés) avait été isolée. Les données ont été extraites des dossiers médicaux et des registres de laboratoire. La colistine n'étant pas testée en routine, la sensibilité à cette molécule n'a pas été évaluée. Résultats. Sept cas ont été diagnostiqués (âge médian : 58 ans ; extrêmes : 48-82 ans ; sex-ratio H/F : 1,3). Klebsiella pneumoniae était le germe prédominant (5/7), suivi de Pseudomonas aeruginosa (1/7) et Acinetobacter baumannii (1/7). Les facteurs de risque étaient : hospitalisation récente (6/7), antibiothérapie récente (6/7), dispositifs invasifs (3/7), infection VIH (2/7). Une co-infection par SARS-CoV-2 était présente chez 5 patients. Le délai médian d'obtention de l'antibiogramme était de 6 jours (extrêmes : 4-8 jours). L'antibiothérapie initiale probabiliste (pipéracilline-tazobactam + gentamicine ou imipénème + amikacine) était en échec à 48 heures chez tous les patients, justifiant un traitement de seconde intention par colistine (5/7) ou imipénème (2/7). Malgré ce réajustement, l'évolution était constamment fatale, tous les patients décédant dans un tableau de choc septique, avec une durée médiane d'hospitalisation de 10 jours (extrêmes : 3-29 jours). Conclusion. Les infections à bactéries pan-résistantes au SMIT d'Abidjan étaient associées à une léthalité de 100 %, dans un contexte de co-infection SARS-CoV-2 fréquent et de retards diagnostiques (délai médian de 6 jours). Le renforcement de la surveillance microbiologique, la réduction du délai d'obtention des antibiogrammes et la mise à disposition de nouveaux antibiotiques (dont la colistine) sont des priorités pour améliorer le pronostic.
ABSTRACT
Introduction. Pan-drug resistance, defined as resistance to all available antibiotic classes, is a growing threat in resource-limited settings where therapeutic options are already constrained. In sub-Saharan Africa, data on these infections are scarce. This study reports our experience in managing documented pan-drug-resistant bacterial infections at the Infectious Diseases Department (SMIT) of Abidjan between March 2020 and February 2022. Methods. We conducted a retrospective observational descriptive study including all hospitalized patients at SMIT in whom a pan-drug-resistant bacterium (resistant to all tested antibiotics) was isolated. Data were extracted from medical records and laboratory registries. Since colistin was not routinely tested, susceptibility to this molecule was not assessed. Results. Seven cases were diagnosed (median age: 58 years; range: 48-82 years; male/female ratio: 1.3). Klebsiella pneumoniae was the predominant pathogen (5/7), followed by Pseudomonas aeruginosa (1/7) and Acinetobacter baumannii (1/7). Risk factors included: recent hospitalization (6/7), recent antibiotic therapy (6/7), invasive devices (3/7), and HIV infection (2/7). SARS-CoV-2 co-infection was present in 5 patients. The median time to antibiogram availability was 6 days (range: 4-8 days). Initial empirical antibiotic therapy (piperacillin-tazobactam + gentamicin or imipenem + amikacin) failed at 48 hours in all patients, requiring second-line treatment with colistin (5/7) or imipenem (2/7). Despite this adjustment, outcome was uniformly fatal, with all patients dying from septic shock, with a median hospitalization duration of 10 days (range: 3-29 days). Conclusion. Pan-drug-resistant bacterial infections at the SMIT Abidjan were associated with 100% mortality, in a context of frequent SARS-CoV-2 co-infection and diagnostic delays (median time of 6 days). Strengthening microbiological surveillance, reducing time to antibiogram availability, and providing access to new antibiotics (including colistin) are priorities to improve prognosis.